Dal 1967 al 2003, il Catalogo pubblico dei libri e dei periodici era il Catalogo dizionario o Catalogo alfabetico generale (autori, titoli, soggetti). È un catalogo cartaceo, a schede, scritto a mano, secondo le Regole di catalogazione della Biblioteca Apostolica Vaticana.

È ancora in uso per la ricerca della maggior parte dei libri pubblicati prima del 2000, ma attualmente è affiancato dalla catalogazione di circa 25.000 monografie, moderne e non, con il sistema informatizzato Index, i cui dati stanno però migrando verso il catalogo on-line del Progetto Biblioteche Ecclesiastiche (PBE), destinato ad essere l’unico catalogo generale elettronico della Biblioteca.
La catalogazione con il software CEI-Bib del PBE è iniziata nel 2008 e il materiale catalogato è consultabile sull’OPAC CEI-Bib all’indirizzo internet http://www.ceibib.it/eosweb/opac/ (limitando la ricerca a: Bergamo - Biblioteca del Seminario vescovile).